Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms