Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABCD3P28288 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABCD3P28288 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABCD3P28288 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABCD3P28288 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABCD3P28288 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABCD3P28288 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABCD3P28288 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABCD3P28288 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABCD3P28288 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABCD3P28288 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABCD3P28288 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABCD3P28288 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABCD3P28288 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABCD3P28288 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABCD3P28288 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABCD3P28288 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABCD3P28288 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms