Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALRP27797 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALRP27797 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALRP27797 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALRP27797 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALRP27797 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALRP27797 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALRP27797 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALRP27797 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALRP27797 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALRP27797 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALRP27797 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALRP27797 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALRP27797 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALRP27797 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALRP27797 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALRP27797 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALRP27797 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALRP27797 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALRP27797 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALRP27797 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALRP27797 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALRP27797 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALRP27797 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALRP27797 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALRP27797 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALRP27797 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALRP27797 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALRP27797 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALRP27797 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALRP27797 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALRP27797 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALRP27797 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALRP27797 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALRP27797 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALRP27797 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALRP27797 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALRP27797 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALRP27797 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALRP27797 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALRP27797 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALRP27797 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALRP27797 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALRP27797 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALRP27797 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALRP27797 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALRP27797 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALRP27797 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALRP27797 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALRP27797 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALRP27797 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALRP27797 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALRP27797 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALRP27797 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALRP27797 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALRP27797 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALRP27797 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALRP27797 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALRP27797 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALRP27797 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALRP27797 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALRP27797 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALRP27797 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALRP27797 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms