Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO1P25800 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO1P25800 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO1P25800 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO1P25800 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO1P25800 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO1P25800 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO1P25800 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO1P25800 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO1P25800 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO1P25800 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO1P25800 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO1P25800 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO1P25800 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO1P25800 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO1P25800 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO1P25800 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO1P25800 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO1P25800 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO1P25800 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO1P25800 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO1P25800 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO1P25800 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO1P25800 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO1P25800 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO1P25800 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO1P25800 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO1P25800 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO1P25800 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO1P25800 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO1P25800 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO1P25800 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO1P25800 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO1P25800 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO1P25800 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO1P25800 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO1P25800 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO1P25800 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO1P25800 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO1P25800 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO1P25800 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO1P25800 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO1P25800 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO1P25800 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO1P25800 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO1P25800 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO1P25800 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO1P25800 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO1P25800 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO1P25800 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO1P25800 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO1P25800 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO1P25800 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO1P25800 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO1P25800 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMO1P25800 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LMO1P25800 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMO1P25800 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMO1P25800 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMO1P25800 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMO1P25800 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMO1P25800 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMO1P25800 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMO1P25800 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMO1P25800 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMO1P25800 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO1P25800 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO1P25800 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO1P25800 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO1P25800 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO1P25800 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO1P25800 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO1P25800 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO1P25800 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO1P25800 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO1P25800 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO1P25800 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO1P25800 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO1P25800 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO1P25800 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO1P25800 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO1P25800 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO1P25800 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO1P25800 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO1P25800 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO1P25800 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO1P25800 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO1P25800 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO1P25800 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO1P25800 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO1P25800 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO1P25800 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO1P25800 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms