Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO2P25791 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO2P25791 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO2P25791 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO2P25791 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO2P25791 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO2P25791 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO2P25791 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO2P25791 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO2P25791 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO2P25791 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO2P25791 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO2P25791 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO2P25791 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO2P25791 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO2P25791 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO2P25791 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO2P25791 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO2P25791 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO2P25791 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO2P25791 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO2P25791 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO2P25791 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO2P25791 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO2P25791 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO2P25791 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO2P25791 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO2P25791 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO2P25791 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO2P25791 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO2P25791 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO2P25791 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO2P25791 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO2P25791 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO2P25791 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO2P25791 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO2P25791 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO2P25791 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO2P25791 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO2P25791 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO2P25791 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO2P25791 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO2P25791 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO2P25791 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO2P25791 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO2P25791 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO2P25791 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO2P25791 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO2P25791 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO2P25791 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO2P25791 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO2P25791 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO2P25791 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO2P25791 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO2P25791 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO2P25791 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO2P25791 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO2P25791 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO2P25791 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO2P25791 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO2P25791 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO2P25791 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO2P25791 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO2P25791 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO2P25791 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO2P25791 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO2P25791 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO2P25791 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO2P25791 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO2P25791 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO2P25791 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO2P25791 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO2P25791 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO2P25791 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO2P25791 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO2P25791 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO2P25791 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO2P25791 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO2P25791 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO2P25791 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO2P25791 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO2P25791 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO2P25791 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO2P25791 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO2P25791 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO2P25791 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO2P25791 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO2P25791 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO2P25791 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO2P25791 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO2P25791 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO2P25791 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO2P25791 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO2P25791 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO2P25791 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO2P25791 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO2P25791 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO2P25791 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO2P25791 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO2P25791 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms