Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCP25054 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APCP25054 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCP25054 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCP25054 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APCP25054 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCP25054 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCP25054 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCP25054 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCP25054 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCP25054 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APCP25054 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCP25054 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCP25054 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCP25054 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCP25054 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCP25054 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCP25054 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCP25054 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCP25054 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCP25054 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCP25054 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCP25054 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCP25054 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCP25054 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCP25054 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APCP25054 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCP25054 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCP25054 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCP25054 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCP25054 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCP25054 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCP25054 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCP25054 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCP25054 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCP25054 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCP25054 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCP25054 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCP25054 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCP25054 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCP25054 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCP25054 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCP25054 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCP25054 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCP25054 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCP25054 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APCP25054 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCP25054 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCP25054 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCP25054 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCP25054 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APCP25054 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCP25054 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCP25054 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCP25054 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCP25054 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCP25054 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCP25054 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCP25054 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCP25054 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCP25054 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCP25054 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCP25054 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCP25054 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCP25054 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APCP25054 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCP25054 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APCP25054 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCP25054 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCP25054 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCP25054 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCP25054 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCP25054 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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APCP25054 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCP25054 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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APCP25054 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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APCP25054 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCP25054 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCP25054 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCP25054 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCP25054 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCP25054 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCP25054 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCP25054 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCP25054 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCP25054 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCP25054 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APCP25054 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCP25054 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCP25054 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCP25054 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APCP25054 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCP25054 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCP25054 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCP25054 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCP25054 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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