Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms