Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPREP23469 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPREP23469 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPREP23469 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPREP23469 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPREP23469 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPREP23469 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPREP23469 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPREP23469 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPREP23469 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPREP23469 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPREP23469 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPREP23469 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPREP23469 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPREP23469 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPREP23469 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPREP23469 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPREP23469 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPREP23469 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPREP23469 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPREP23469 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPREP23469 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPREP23469 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPREP23469 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPREP23469 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPREP23469 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPREP23469 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPREP23469 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPREP23469 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPREP23469 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPREP23469 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPREP23469 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPREP23469 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPREP23469 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPREP23469 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPREP23469 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPREP23469 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPREP23469 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPREP23469 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPREP23469 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPREP23469 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPREP23469 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPREP23469 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPREP23469 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPREP23469 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPREP23469 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPREP23469 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPREP23469 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPREP23469 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPREP23469 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPREP23469 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPREP23469 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPREP23469 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPREP23469 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPREP23469 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPREP23469 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPREP23469 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPREP23469 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPREP23469 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPREP23469 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPREP23469 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPREP23469 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPREP23469 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPREP23469 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPREP23469 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPREP23469 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPREP23469 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPREP23469 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPREP23469 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPREP23469 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPREP23469 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPREP23469 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPREP23469 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPREP23469 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPREP23469 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPREP23469 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPREP23469 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPREP23469 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPREP23469 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPREP23469 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPREP23469 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPREP23469 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPREP23469 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPREP23469 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPREP23469 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPREP23469 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPREP23469 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPREP23469 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPREP23469 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPREP23469 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPREP23469 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPREP23469 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPREP23469 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPREP23469 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPREP23469 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPREP23469 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPREP23469 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPREP23469 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPREP23469 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPREP23469 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms