Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCL3P20749 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCL3P20749 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCL3P20749 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCL3P20749 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCL3P20749 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCL3P20749 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCL3P20749 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCL3P20749 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCL3P20749 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCL3P20749 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCL3P20749 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCL3P20749 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCL3P20749 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCL3P20749 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCL3P20749 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCL3P20749 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCL3P20749 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCL3P20749 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCL3P20749 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCL3P20749 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCL3P20749 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCL3P20749 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCL3P20749 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCL3P20749 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCL3P20749 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCL3P20749 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCL3P20749 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCL3P20749 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BCL3P20749 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCL3P20749 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCL3P20749 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BCL3P20749 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCL3P20749 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCL3P20749 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms