Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB5AP20339 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB5AP20339 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB5AP20339 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB5AP20339 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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RAB5AP20339 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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RAB5AP20339 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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RAB5AP20339 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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RAB5AP20339 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RAB5AP20339 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB5AP20339 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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RAB5AP20339 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB5AP20339 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB5AP20339 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB5AP20339 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB5AP20339 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB5AP20339 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB5AP20339 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB5AP20339 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB5AP20339 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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