Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms