Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF3P17036 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms