Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA1P15085 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA1P15085 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA1P15085 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA1P15085 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA1P15085 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA1P15085 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA1P15085 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA1P15085 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA1P15085 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA1P15085 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA1P15085 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA1P15085 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA1P15085 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA1P15085 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA1P15085 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA1P15085 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA1P15085 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA1P15085 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA1P15085 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA1P15085 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA1P15085 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA1P15085 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA1P15085 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA1P15085 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA1P15085 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA1P15085 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA1P15085 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA1P15085 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA1P15085 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA1P15085 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA1P15085 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA1P15085 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA1P15085 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA1P15085 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA1P15085 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA1P15085 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA1P15085 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA1P15085 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA1P15085 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA1P15085 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA1P15085 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA1P15085 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA1P15085 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA1P15085 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA1P15085 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA1P15085 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA1P15085 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA1P15085 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA1P15085 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA1P15085 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA1P15085 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA1P15085 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA1P15085 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA1P15085 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA1P15085 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA1P15085 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA1P15085 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA1P15085 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA1P15085 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA1P15085 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA1P15085 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA1P15085 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA1P15085 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA1P15085 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA1P15085 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA1P15085 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA1P15085 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms