Protein–RNA interactions for Protein: P13804

ETFA, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFAP13804 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETFAP13804 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETFAP13804 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETFAP13804 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETFAP13804 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ETFAP13804 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ETFAP13804 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ETFAP13804 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ETFAP13804 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
ETFAP13804 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ETFAP13804 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFAP13804 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFAP13804 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFAP13804 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFAP13804 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFAP13804 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFAP13804 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFAP13804 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFAP13804 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFAP13804 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFAP13804 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFAP13804 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFAP13804 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFAP13804 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFAP13804 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFAP13804 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFAP13804 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFAP13804 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFAP13804 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFAP13804 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFAP13804 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFAP13804 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFAP13804 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFAP13804 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFAP13804 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFAP13804 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFAP13804 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFAP13804 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFAP13804 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFAP13804 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFAP13804 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFAP13804 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFAP13804 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFAP13804 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFAP13804 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFAP13804 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFAP13804 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFAP13804 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFAP13804 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFAP13804 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFAP13804 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFAP13804 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFAP13804 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFAP13804 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFAP13804 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFAP13804 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFAP13804 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFAP13804 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFAP13804 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFAP13804 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFAP13804 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFAP13804 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFAP13804 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFAP13804 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFAP13804 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFAP13804 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFAP13804 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFAP13804 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFAP13804 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms