Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYL1P12980 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYL1P12980 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYL1P12980 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYL1P12980 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYL1P12980 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYL1P12980 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYL1P12980 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYL1P12980 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYL1P12980 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYL1P12980 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYL1P12980 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYL1P12980 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYL1P12980 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYL1P12980 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYL1P12980 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYL1P12980 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LYL1P12980 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYL1P12980 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYL1P12980 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LYL1P12980 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LYL1P12980 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYL1P12980 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYL1P12980 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYL1P12980 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYL1P12980 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYL1P12980 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYL1P12980 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYL1P12980 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYL1P12980 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms