Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms