Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP3P12645 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP3P12645 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP3P12645 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP3P12645 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP3P12645 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP3P12645 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP3P12645 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP3P12645 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP3P12645 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP3P12645 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP3P12645 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP3P12645 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP3P12645 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP3P12645 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP3P12645 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP3P12645 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP3P12645 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP3P12645 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP3P12645 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP3P12645 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP3P12645 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP3P12645 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP3P12645 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP3P12645 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP3P12645 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP3P12645 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP3P12645 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMP3P12645 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMP3P12645 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMP3P12645 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMP3P12645 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMP3P12645 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMP3P12645 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMP3P12645 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMP3P12645 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMP3P12645 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BMP3P12645 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMP3P12645 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMP3P12645 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMP3P12645 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMP3P12645 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMP3P12645 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMP3P12645 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMP3P12645 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMP3P12645 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMP3P12645 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BMP3P12645 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP3P12645 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP3P12645 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP3P12645 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP3P12645 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP3P12645 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP3P12645 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP3P12645 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP3P12645 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP3P12645 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP3P12645 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP3P12645 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP3P12645 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP3P12645 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP3P12645 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP3P12645 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP3P12645 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP3P12645 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP3P12645 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP3P12645 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP3P12645 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP3P12645 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP3P12645 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP3P12645 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP3P12645 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP3P12645 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BMP3P12645 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BMP3P12645 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BMP3P12645 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BMP3P12645 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BMP3P12645 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BMP3P12645 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BMP3P12645 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BMP3P12645 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BMP3P12645 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BMP3P12645 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BMP3P12645 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BMP3P12645 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BMP3P12645 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BMP3P12645 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BMP3P12645 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BMP3P12645 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BMP3P12645 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BMP3P12645 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BMP3P12645 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BMP3P12645 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BMP3P12645 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BMP3P12645 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms