Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODC1P11926 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ODC1P11926 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ODC1P11926 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODC1P11926 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODC1P11926 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODC1P11926 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODC1P11926 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODC1P11926 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODC1P11926 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODC1P11926 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODC1P11926 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ODC1P11926 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODC1P11926 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODC1P11926 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODC1P11926 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODC1P11926 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODC1P11926 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODC1P11926 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODC1P11926 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODC1P11926 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODC1P11926 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODC1P11926 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODC1P11926 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODC1P11926 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ODC1P11926 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODC1P11926 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODC1P11926 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODC1P11926 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODC1P11926 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODC1P11926 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODC1P11926 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODC1P11926 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODC1P11926 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODC1P11926 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODC1P11926 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODC1P11926 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ODC1P11926 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ODC1P11926 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ODC1P11926 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ODC1P11926 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ODC1P11926 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODC1P11926 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ODC1P11926 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODC1P11926 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODC1P11926 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODC1P11926 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODC1P11926 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODC1P11926 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODC1P11926 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODC1P11926 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODC1P11926 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODC1P11926 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODC1P11926 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ODC1P11926 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODC1P11926 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ODC1P11926 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ODC1P11926 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODC1P11926 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODC1P11926 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODC1P11926 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODC1P11926 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODC1P11926 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODC1P11926 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODC1P11926 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ODC1P11926 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODC1P11926 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODC1P11926 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODC1P11926 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODC1P11926 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODC1P11926 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODC1P11926 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODC1P11926 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODC1P11926 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODC1P11926 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODC1P11926 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ODC1P11926 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODC1P11926 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ODC1P11926 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODC1P11926 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODC1P11926 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODC1P11926 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODC1P11926 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODC1P11926 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODC1P11926 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODC1P11926 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODC1P11926 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODC1P11926 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODC1P11926 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODC1P11926 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODC1P11926 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODC1P11926 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODC1P11926 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODC1P11926 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODC1P11926 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODC1P11926 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODC1P11926 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODC1P11926 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODC1P11926 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ODC1P11926 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms