Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI4P10075 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI4P10075 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI4P10075 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI4P10075 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI4P10075 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI4P10075 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI4P10075 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI4P10075 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI4P10075 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI4P10075 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI4P10075 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI4P10075 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI4P10075 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI4P10075 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI4P10075 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI4P10075 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI4P10075 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI4P10075 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI4P10075 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI4P10075 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI4P10075 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI4P10075 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI4P10075 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GLI4P10075 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GLI4P10075 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GLI4P10075 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GLI4P10075 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GLI4P10075 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GLI4P10075 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GLI4P10075 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GLI4P10075 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GLI4P10075 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GLI4P10075 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GLI4P10075 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GLI4P10075 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GLI4P10075 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GLI4P10075 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GLI4P10075 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GLI4P10075 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GLI4P10075 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GLI4P10075 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GLI4P10075 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GLI4P10075 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GLI4P10075 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GLI4P10075 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GLI4P10075 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GLI4P10075 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GLI4P10075 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GLI4P10075 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GLI4P10075 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GLI4P10075 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GLI4P10075 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GLI4P10075 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GLI4P10075 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GLI4P10075 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GLI4P10075 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GLI4P10075 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GLI4P10075 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GLI4P10075 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GLI4P10075 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GLI4P10075 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GLI4P10075 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GLI4P10075 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GLI4P10075 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GLI4P10075 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GLI4P10075 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GLI4P10075 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms