Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI2P10070 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI2P10070 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI2P10070 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI2P10070 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI2P10070 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI2P10070 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI2P10070 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GLI2P10070 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GLI2P10070 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GLI2P10070 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
GLI2P10070 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GLI2P10070 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GLI2P10070 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GLI2P10070 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GLI2P10070 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GLI2P10070 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
GLI2P10070 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GLI2P10070 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GLI2P10070 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GLI2P10070 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GLI2P10070 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GLI2P10070 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GLI2P10070 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GLI2P10070 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GLI2P10070 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GLI2P10070 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
GLI2P10070 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GLI2P10070 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GLI2P10070 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GLI2P10070 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GLI2P10070 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
GLI2P10070 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
GLI2P10070 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GLI2P10070 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GLI2P10070 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GLI2P10070 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
GLI2P10070 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI2P10070 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI2P10070 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI2P10070 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI2P10070 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI2P10070 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI2P10070 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI2P10070 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI2P10070 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI2P10070 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI2P10070 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI2P10070 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI2P10070 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI2P10070 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI2P10070 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI2P10070 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI2P10070 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI2P10070 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GLI2P10070 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GLI2P10070 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GLI2P10070 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GLI2P10070 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GLI2P10070 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GLI2P10070 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GLI2P10070 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GLI2P10070 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GLI2P10070 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GLI2P10070 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GLI2P10070 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GLI2P10070 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GLI2P10070 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GLI2P10070 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GLI2P10070 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GLI2P10070 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GLI2P10070 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GLI2P10070 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GLI2P10070 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GLI2P10070 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GLI2P10070 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GLI2P10070 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GLI2P10070 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GLI2P10070 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GLI2P10070 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GLI2P10070 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GLI2P10070 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GLI2P10070 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GLI2P10070 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GLI2P10070 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GLI2P10070 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GLI2P10070 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLI2P10070 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLI2P10070 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLI2P10070 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLI2P10070 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLI2P10070 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLI2P10070 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLI2P10070 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLI2P10070 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
GLI2P10070 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLI2P10070 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLI2P10070 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLI2P10070 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLI2P10070 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms