Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD2P0DJD1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms