Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms