Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms