Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GLI1P08151 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GLI1P08151 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GLI1P08151 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GLI1P08151 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GLI1P08151 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GLI1P08151 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GLI1P08151 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GLI1P08151 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI1P08151 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GLI1P08151 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GLI1P08151 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GLI1P08151 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GLI1P08151 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GLI1P08151 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GLI1P08151 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GLI1P08151 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GLI1P08151 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GLI1P08151 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GLI1P08151 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GLI1P08151 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GLI1P08151 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GLI1P08151 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GLI1P08151 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GLI1P08151 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GLI1P08151 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI1P08151 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI1P08151 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI1P08151 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI1P08151 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI1P08151 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI1P08151 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI1P08151 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI1P08151 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI1P08151 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI1P08151 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI1P08151 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI1P08151 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI1P08151 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI1P08151 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI1P08151 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI1P08151 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI1P08151 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI1P08151 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI1P08151 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI1P08151 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI1P08151 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI1P08151 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI1P08151 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI1P08151 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI1P08151 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI1P08151 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI1P08151 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI1P08151 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI1P08151 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI1P08151 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI1P08151 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI1P08151 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI1P08151 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI1P08151 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI1P08151 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI1P08151 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI1P08151 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI1P08151 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI1P08151 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI1P08151 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI1P08151 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI1P08151 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms