Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms