Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFNA4P05014 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms