Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGAP02671 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGAP02671 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGAP02671 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGAP02671 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGAP02671 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGAP02671 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGAP02671 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGAP02671 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGAP02671 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGAP02671 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGAP02671 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGAP02671 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGAP02671 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGAP02671 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGAP02671 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGAP02671 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGAP02671 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGAP02671 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGAP02671 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGAP02671 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGAP02671 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGAP02671 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGAP02671 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGAP02671 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGAP02671 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGAP02671 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGAP02671 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FGAP02671 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FGAP02671 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FGAP02671 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FGAP02671 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGAP02671 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGAP02671 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGAP02671 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGAP02671 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGAP02671 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGAP02671 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGAP02671 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGAP02671 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGAP02671 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGAP02671 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGAP02671 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGAP02671 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGAP02671 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGAP02671 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGAP02671 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGAP02671 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGAP02671 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGAP02671 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGAP02671 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGAP02671 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGAP02671 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGAP02671 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGAP02671 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGAP02671 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGAP02671 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGAP02671 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FGAP02671 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGAP02671 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGAP02671 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGAP02671 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGAP02671 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGAP02671 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGAP02671 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGAP02671 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGAP02671 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGAP02671 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGAP02671 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGAP02671 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGAP02671 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGAP02671 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGAP02671 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGAP02671 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGAP02671 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FGAP02671 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGAP02671 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGAP02671 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGAP02671 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGAP02671 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGAP02671 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGAP02671 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGAP02671 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGAP02671 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGAP02671 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGAP02671 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGAP02671 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGAP02671 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGAP02671 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGAP02671 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGAP02671 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FGAP02671 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGAP02671 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FGAP02671 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGAP02671 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGAP02671 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGAP02671 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGAP02671 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGAP02671 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGAP02671 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms