Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOC1P02654 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
APOC1P02654 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
APOC1P02654 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
APOC1P02654 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
APOC1P02654 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
APOC1P02654 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
APOC1P02654 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
APOC1P02654 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC1P02654 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC1P02654 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC1P02654 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC1P02654 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC1P02654 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC1P02654 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC1P02654 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC1P02654 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC1P02654 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC1P02654 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC1P02654 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC1P02654 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC1P02654 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOC1P02654 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC1P02654 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC1P02654 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC1P02654 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC1P02654 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC1P02654 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC1P02654 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC1P02654 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC1P02654 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC1P02654 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC1P02654 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC1P02654 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC1P02654 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC1P02654 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC1P02654 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC1P02654 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC1P02654 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC1P02654 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC1P02654 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC1P02654 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC1P02654 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC1P02654 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC1P02654 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC1P02654 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC1P02654 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC1P02654 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC1P02654 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOC1P02654 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms