Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA1P02647 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA1P02647 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA1P02647 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA1P02647 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA1P02647 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA1P02647 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA1P02647 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA1P02647 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA1P02647 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA1P02647 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA1P02647 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA1P02647 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA1P02647 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA1P02647 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA1P02647 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA1P02647 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA1P02647 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA1P02647 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA1P02647 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA1P02647 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA1P02647 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA1P02647 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA1P02647 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA1P02647 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA1P02647 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA1P02647 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA1P02647 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA1P02647 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA1P02647 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA1P02647 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA1P02647 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA1P02647 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA1P02647 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA1P02647 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA1P02647 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA1P02647 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA1P02647 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA1P02647 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA1P02647 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA1P02647 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA1P02647 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA1P02647 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA1P02647 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA1P02647 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA1P02647 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA1P02647 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA1P02647 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA1P02647 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA1P02647 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOA1P02647 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOA1P02647 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOA1P02647 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOA1P02647 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOA1P02647 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOA1P02647 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOA1P02647 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms