Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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