Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN9O95484 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN9O95484 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN9O95484 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN9O95484 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN9O95484 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN9O95484 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN9O95484 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN9O95484 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN9O95484 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN9O95484 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN9O95484 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN9O95484 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms