Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEBLO76041 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEBLO76041 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEBLO76041 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEBLO76041 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEBLO76041 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEBLO76041 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEBLO76041 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEBLO76041 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEBLO76041 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEBLO76041 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEBLO76041 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEBLO76041 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEBLO76041 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEBLO76041 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEBLO76041 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEBLO76041 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEBLO76041 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEBLO76041 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEBLO76041 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEBLO76041 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEBLO76041 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEBLO76041 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEBLO76041 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NEBLO76041 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NEBLO76041 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
NEBLO76041 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NEBLO76041 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NEBLO76041 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NEBLO76041 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEBLO76041 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEBLO76041 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEBLO76041 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEBLO76041 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEBLO76041 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEBLO76041 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEBLO76041 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEBLO76041 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEBLO76041 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEBLO76041 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEBLO76041 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEBLO76041 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEBLO76041 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NEBLO76041 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEBLO76041 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NEBLO76041 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEBLO76041 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEBLO76041 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEBLO76041 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEBLO76041 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEBLO76041 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEBLO76041 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEBLO76041 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEBLO76041 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEBLO76041 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NEBLO76041 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEBLO76041 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEBLO76041 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NEBLO76041 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEBLO76041 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEBLO76041 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEBLO76041 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEBLO76041 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NEBLO76041 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEBLO76041 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEBLO76041 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEBLO76041 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NEBLO76041 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NEBLO76041 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
NEBLO76041 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NEBLO76041 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEBLO76041 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEBLO76041 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEBLO76041 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEBLO76041 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NEBLO76041 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEBLO76041 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NEBLO76041 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEBLO76041 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEBLO76041 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEBLO76041 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEBLO76041 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEBLO76041 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEBLO76041 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEBLO76041 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEBLO76041 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEBLO76041 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEBLO76041 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEBLO76041 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NEBLO76041 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEBLO76041 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEBLO76041 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEBLO76041 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEBLO76041 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEBLO76041 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEBLO76041 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEBLO76041 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEBLO76041 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEBLO76041 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEBLO76041 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms