Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA10O75578 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms