Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms