Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSVO60911 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSVO60911 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSVO60911 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSVO60911 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSVO60911 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSVO60911 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSVO60911 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSVO60911 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSVO60911 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSVO60911 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSVO60911 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSVO60911 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSVO60911 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSVO60911 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSVO60911 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSVO60911 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSVO60911 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSVO60911 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSVO60911 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSVO60911 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSVO60911 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSVO60911 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSVO60911 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSVO60911 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSVO60911 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSVO60911 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSVO60911 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSVO60911 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSVO60911 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSVO60911 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSVO60911 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSVO60911 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSVO60911 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSVO60911 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSVO60911 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSVO60911 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSVO60911 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSVO60911 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSVO60911 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSVO60911 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSVO60911 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSVO60911 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSVO60911 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSVO60911 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSVO60911 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSVO60911 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSVO60911 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSVO60911 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSVO60911 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSVO60911 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSVO60911 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSVO60911 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSVO60911 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSVO60911 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSVO60911 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSVO60911 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSVO60911 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSVO60911 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSVO60911 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSVO60911 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSVO60911 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSVO60911 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSVO60911 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSVO60911 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSVO60911 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSVO60911 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSVO60911 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSVO60911 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSVO60911 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSVO60911 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSVO60911 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSVO60911 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSVO60911 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSVO60911 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSVO60911 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSVO60911 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSVO60911 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSVO60911 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSVO60911 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSVO60911 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSVO60911 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSVO60911 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CTSVO60911 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTSVO60911 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTSVO60911 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSVO60911 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSVO60911 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSVO60911 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSVO60911 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSVO60911 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSVO60911 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSVO60911 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSVO60911 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSVO60911 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSVO60911 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSVO60911 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSVO60911 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSVO60911 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSVO60911 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms