Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSCO60682 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSCO60682 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSCO60682 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MSCO60682 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MSCO60682 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSCO60682 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSCO60682 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSCO60682 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSCO60682 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSCO60682 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSCO60682 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSCO60682 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSCO60682 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSCO60682 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSCO60682 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSCO60682 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MSCO60682 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSCO60682 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSCO60682 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSCO60682 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSCO60682 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSCO60682 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSCO60682 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSCO60682 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSCO60682 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSCO60682 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSCO60682 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSCO60682 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSCO60682 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSCO60682 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSCO60682 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSCO60682 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSCO60682 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSCO60682 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSCO60682 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSCO60682 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSCO60682 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSCO60682 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MSCO60682 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSCO60682 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSCO60682 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSCO60682 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MSCO60682 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSCO60682 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSCO60682 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSCO60682 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSCO60682 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSCO60682 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSCO60682 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSCO60682 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSCO60682 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSCO60682 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSCO60682 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSCO60682 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MSCO60682 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSCO60682 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSCO60682 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSCO60682 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSCO60682 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MSCO60682 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSCO60682 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MSCO60682 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSCO60682 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSCO60682 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSCO60682 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSCO60682 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSCO60682 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSCO60682 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSCO60682 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSCO60682 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSCO60682 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSCO60682 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSCO60682 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSCO60682 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSCO60682 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSCO60682 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSCO60682 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSCO60682 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSCO60682 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSCO60682 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSCO60682 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSCO60682 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSCO60682 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSCO60682 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSCO60682 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSCO60682 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSCO60682 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSCO60682 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSCO60682 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSCO60682 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSCO60682 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSCO60682 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSCO60682 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSCO60682 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSCO60682 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSCO60682 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSCO60682 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MSCO60682 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSCO60682 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms