Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms