Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF1O43189 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF1O43189 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF1O43189 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF1O43189 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF1O43189 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF1O43189 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF1O43189 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF1O43189 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF1O43189 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF1O43189 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF1O43189 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PHF1O43189 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PHF1O43189 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PHF1O43189 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PHF1O43189 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF1O43189 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF1O43189 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF1O43189 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF1O43189 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF1O43189 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF1O43189 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF1O43189 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF1O43189 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF1O43189 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF1O43189 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF1O43189 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF1O43189 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF1O43189 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF1O43189 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF1O43189 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms