Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms