Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms