Protein–RNA interactions for Protein: O15066

KIF3B, Kinesin-like protein KIF3B, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3BO15066 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF3BO15066 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms