Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms