Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms