Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELL2O00472 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELL2O00472 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELL2O00472 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELL2O00472 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELL2O00472 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELL2O00472 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELL2O00472 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELL2O00472 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELL2O00472 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ELL2O00472 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELL2O00472 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELL2O00472 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELL2O00472 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELL2O00472 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELL2O00472 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELL2O00472 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELL2O00472 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELL2O00472 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELL2O00472 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ELL2O00472 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ELL2O00472 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ELL2O00472 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ELL2O00472 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ELL2O00472 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ELL2O00472 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ELL2O00472 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ELL2O00472 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ELL2O00472 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ELL2O00472 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ELL2O00472 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ELL2O00472 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ELL2O00472 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ELL2O00472 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ELL2O00472 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ELL2O00472 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ELL2O00472 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ELL2O00472 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ELL2O00472 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ELL2O00472 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ELL2O00472 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ELL2O00472 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ELL2O00472 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ELL2O00472 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ELL2O00472 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ELL2O00472 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ELL2O00472 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ELL2O00472 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ELL2O00472 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ELL2O00472 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ELL2O00472 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ELL2O00472 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ELL2O00472 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ELL2O00472 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ELL2O00472 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ELL2O00472 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ELL2O00472 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ELL2O00472 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ELL2O00472 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ELL2O00472 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ELL2O00472 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ELL2O00472 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ELL2O00472 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ELL2O00472 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ELL2O00472 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ELL2O00472 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ELL2O00472 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ELL2O00472 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ELL2O00472 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ELL2O00472 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ELL2O00472 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ELL2O00472 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ELL2O00472 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ELL2O00472 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ELL2O00472 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ELL2O00472 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ELL2O00472 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ELL2O00472 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ELL2O00472 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ELL2O00472 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ELL2O00472 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ELL2O00472 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ELL2O00472 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ELL2O00472 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ELL2O00472 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ELL2O00472 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ELL2O00472 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ELL2O00472 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ELL2O00472 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELL2O00472 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELL2O00472 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELL2O00472 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELL2O00472 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELL2O00472 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELL2O00472 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ELL2O00472 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELL2O00472 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELL2O00472 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELL2O00472 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELL2O00472 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms