Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms