Protein–RNA interactions for Protein: J3QW42

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QW42 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3QW42 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3QW42 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QW42 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QW42 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QW42 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QW42 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QW42 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QW42 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QW42 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QW42 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QW42 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QW42 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QW42 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QW42 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QW42 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QW42 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QW42 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QW42 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QW42 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QW42 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QW42 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QW42 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QW42 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QW42 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QW42 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QW42 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QW42 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QW42 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QW42 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QW42 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QW42 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QW42 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QW42 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QW42 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QW42 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QW42 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QW42 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QW42 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QW42 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QW42 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QW42 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QW42 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QW42 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QW42 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QW42 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QW42 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QW42 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QW42 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QW42 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QW42 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QW42 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QW42 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QW42 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QW42 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QW42 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QW42 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QW42 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QW42 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QW42 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QW42 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QW42 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QW42 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QW42 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QW42 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QW42 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QW42 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QW42 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QW42 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QW42 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QW42 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QW42 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QW42 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QW42 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QW42 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QW42 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QW42 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QW42 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QW42 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QW42 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QW42 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QW42 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QW42 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QW42 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms