Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
E9PCH4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
E9PCH4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
E9PCH4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
E9PCH4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
E9PCH4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
E9PCH4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
E9PCH4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
E9PCH4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
E9PCH4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
E9PCH4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
E9PCH4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
E9PCH4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
E9PCH4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
E9PCH4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
E9PCH4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
E9PCH4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
E9PCH4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
E9PCH4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
E9PCH4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
E9PCH4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
E9PCH4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
E9PCH4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
E9PCH4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
E9PCH4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
E9PCH4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
E9PCH4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
E9PCH4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
E9PCH4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
E9PCH4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
E9PCH4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
E9PCH4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
E9PCH4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
E9PCH4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
E9PCH4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
E9PCH4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
E9PCH4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
E9PCH4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
E9PCH4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
E9PCH4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
E9PCH4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
E9PCH4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
E9PCH4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
E9PCH4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
E9PCH4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
E9PCH4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
E9PCH4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
E9PCH4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
E9PCH4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
E9PCH4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
E9PCH4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
E9PCH4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
E9PCH4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
E9PCH4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
E9PCH4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
E9PCH4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
E9PCH4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
E9PCH4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
E9PCH4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
E9PCH4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
E9PCH4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
E9PCH4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
E9PCH4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
E9PCH4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
E9PCH4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
E9PCH4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
E9PCH4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
E9PCH4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
E9PCH4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
E9PCH4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
E9PCH4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
E9PCH4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
E9PCH4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
E9PCH4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
E9PCH4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
E9PCH4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
E9PCH4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
E9PCH4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
E9PCH4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
E9PCH4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
E9PCH4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
E9PCH4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
E9PCH4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
E9PCH4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
E9PCH4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
E9PCH4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
E9PCH4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
E9PCH4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
E9PCH4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
E9PCH4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
E9PCH4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
E9PCH4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
E9PCH4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
E9PCH4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
E9PCH4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
E9PCH4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
E9PCH4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
E9PCH4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
E9PCH4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
E9PCH4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms