Protein–RNA interactions for Protein: D3W0D1

KLRF2, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF2D3W0D1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLRF2D3W0D1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms