Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L12C9JPN9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms