Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-1B6SEH8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms